張貼日期: Oct 2, 2018
本快速入門會在 AWS 雲端上部署 Dynamic Read Analysis for GENomics Complete Suite (DRAGEN CS),這是 Illumina 推出的資料分析平台,整個過程大約需要 15 分鐘的時間。
DRAGEN CS 可以對下一代定序 (NGS) 資料進行超快速分析,大幅縮短分析基因組資料所需的時間,並提高準確性。它包括生物資訊學管道,為映射、比對、分類、重複標記和單倍型變體呼叫提供高度優化的演算法。這些管道包括 DRAGEN Germline V2、DRAGEN Somatic V2 (腫瘤和腫瘤/正常)、DRAGEN Virtual Long Read Detection (VLRD)、DRAGEN RNA Gene Fusion、DRAGEN Joint Genotyping 和 GATK 最佳實務。
快速入門可建立跨兩個可用區域的 AWS 環境以提供高可用性,以及為 Spot 執行個體和隨需執行個體佈建兩個 AWS Batch 運算環境。這些環境包括 DRAGEN F1 執行個體,它們連接到現場可程式化閘陣列 (FPGA) 以進行硬體加速。
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