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Conjuntos de datos abiertos
El programa de datos abiertos (ODP) de AWS ayuda a democratizar el acceso a los datos al hacer que estén fácilmente disponibles en Amazon S3, lo que supone brindar a la comunidad investigadora una única fuente documentada de veracidad. Para una lista completa de los más de 40 conjuntos de datos abiertos de genómica disponibles, consulte el programa de datos abiertos (Open Data Program, ODP) de AWS.
Casos prácticos
Ancestry cuenta con Amazon EFS para habilitar a muchos científicos para realizar búsquedas genómicas, escalar la capacidad de cómputo y almacenamiento de manera vertical u horizontal e incorporar científicos con más rapidez.
La compañía de software para genómica global Lifebit Biotech Ltd. utilizó AWS para crear el primer sistema de análisis federado para datos genómicos, y brindar seguridad, conformidad y búsqueda de enfermedades acelerada.
Biogen, una compañía de ciencias biológicas dedicada a erradicar enfermedades neurológicas, implementó una solución que prioriza la nube basada en la infraestructura de AWS para procesar y analizar datos médicos de 500 000 participantes en UK Biobank.
La Melbourne Genomics Health Alliance creó su sistema GenoVic en AWS. GenoVic permite realizar pruebas genómicas de enfermedades raras y cáncer, y mejora la eficiencia del flujo de trabajo de pruebas, escala para satisfacer la demanda y permite la incorporación de nuevos laboratorios de pruebas en cuestión de meses. Ubicada en Victoria, Australia, esta alianza reúne a los principales hospitales y organizaciones de investigación. GenoVic, un sistema clínico compartido para pruebas genómicas, utiliza AWS Lambda para cómputo sin servidor, AWS Batch para programar trabajos de procesamiento por lotes y Amazon S3 para almacenar datos genómicos.
Illumina está utilizando AWS para ahorrar cerca de 400 000 USD al mes, potenciar la expansión global y ayudar a los investigadores genómicos a acelerar sus descubrimientos. La compañía brinda hardware y software para secuenciación y análisis genómico.
DNAnexus ofrece una plataforma como servicio para investigadores del sector de la genómica en más de 100 empresas de todo el mundo. En AWS, DNAnexus ajusta su escala a decenas de millones de horas de análisis y almacena petabytes de datos en un entorno que cumple los requisitos de conformidad de la ley HIPAA.