Nationwide Children’s Hospital benutzt AWS Technology für die Datenverarbeitung und die Sicherung von klinischen Genomik-Daten

Nationwide Children’s Hospital (Nationwide Children’s) steht vor der Herausforderung Computing-intensive klinische Genomik-Daten sicher und in großem Umfang zu verarbeiten, um Patienten zu diagnostizieren und zu behandeln, und arbeitet gleichzeitig um ein besseres Verständnis der menschlichen Genomik zu erlangen. Nationwide Children’s benutzt Amazon Web Services (AWS)-Tools für die Datenverarbeitung und die Sicherheit.

Auf der grundlegendsten Ebene ist die Genomik die Programmiersprache des Lebens, aber das Verständnis menschlicher Genome und die Bestimmung von Genomik-Varianten in spezifischen klinischen Fällen sind immens komplizierte Aufgaben. Im Jahr 2016 hat sich Nationwide Children's vorgenommen, nicht nur die Genomik-Forschung, sondern auch die klinische Genomik zu erweitern. „In einer klinischen Situation führen wir jedes Jahr Tausende von klinischen Exomen und Panels durch“, sagt Grant Lammi, Cloud Development Manager am The Steve and Cindy Rasmussen Institute for Genomic Medicine, das Teil von Nationwide Children's ist. Die genetische Sequenzierung in diesem Maßstab erfordert eine enorme Computing-Leistung, und die HIPAA-Anforderungen machen die Sicherheit zu einem vorrangigen Thema. Darafhin entwickelte Nationwide Children's Hospital eine Reihe von weitgehend Serverless-Bioinformatik-Tools, um die klinische Genomik von der Vorbereitung der DNA auf die Sequenzierung bis zur Analyse der DNA-Sequenzdaten und darüber hinaus sicher zu gestalten.

Nationwide Children's suchte bei AWS nach der enormen Rechenleistung und dem Speicherplatz, den es für die Durchführung klinischer Genomik benötigt. Die Data Pipeline von Nationwide Children, die intern entwickelt und in der Cloud gehostet wird, ist praktisch unbegrenzt skalierbar, was bedeutet, dass sie Sequenzdaten schnell analysieren und die Zeit bis zur Bereitstellung der Ergebnisse für die Patienten verkürzen kann. Da Sicherheit eine wesentliche Herausforderung beim Umgang mit klinischen Genomik-Daten ist, wandte sich Nationwide Children's auch an AWS, um Tools für die Integration von Sicherheit in seine Cloud-Anwendungen zu erhalten. „Wir wollen uns nicht um das Patchen von Servern und das Verfolgen von Exploits und dergleichen kümmern müssen“, sagt Lammi. „Das alles wird auf die AWS-Teams abgewälzt. So können wir uns der Wissenschaft widmen, und das ist es, was wir tun wollen.“