Dokumentation

  • Benutzerhandbuch

    Weitere Informationen zur Verwendung von AWS HealthOmics finden Sie im Schritt-für-Schritt-Entwicklerhandbuch.

  • API-Referenz

    Lesen Sie dieses Referenzhandbuch für AWS-HealthOmics-APIs und -Parameter.

Tutorials

  • Umfassender HealthOmics-Workshop

    Einstieg in HealthOmics-Workflows und Speicher

  • HealthOmics-Tutorials

    Open-Source-Repository in GitHub mit Beispielcode, der anzeigt, wie genomische und biologische Datensätze mit AWS HealthOmics gespeichert, verarbeitet und abgefragt werden

Tools

Workflow-Tools

Workflows in der Arzneimittelforschung

Diese Sammlung von AWS-HealthOmics-Workflows zur Beschleunigung der Arzneimittelforschung verwenden

Beispiel-Workflows

Private Workflows basierend auf Open-Source-Workflow-Beispielen für HealthOmics erstellen

Ausführungs-Analyzer

Ausführungs-Analyzer ist ein Tool zur Optimierung der Ausführungsleistung, das Protokolle von Ausführungsmanifesten aus CloudWatch abruft und Statistiken für eine Ausführung generiert, einschließlich der CPU- und Speicherauslastung für jede Aufgabe im Workflow

WDL Linter

Nutzung des HealthOmics-WDL-Linters zur Erkennung häufiger Workflow-Fehler vor der Ausführung von Workflows

Nextflow Linter

Lint für häufige Nextflow-Fehler, bevor ein Workflow-Skript ausgeführt wird

ECR-Helfer

Vorhandene Container mit dem ECR-Helfertool in Ihr privates ECR-Repository migrieren

Tool erneut ausführen

Archivierte Läufe aus CloudWatch-Ausführungs-Manifestprotokollen erneut ausführen

Tools zur Datenspeicherung

Lesesatz-Transfer-Manager

Einfaches Herunterladen von Dateien aus einem AWS HealthOmics-Referenz- oder Lesesatz

Ereignisgesteuerter Importeur

CDK-App, die eine ereignisgesteuerte Architektur demonstriert, die den Import von Daten in AWS HealthOmics-Sequenzspeicher automatisiert, wenn Objekte in Amazon S3 erstellt werden.

Sequenzspeicher-Manifestgenerator

Generiert ein JSON-Manifest für AWS-HealthOmics-Sequenzspeicher-Importaufträge

Suchfunktion für doppelte Lesesätze im Sequenzspeicher

Identifiziert doppelte Lesesätze, die in AWS-HealthOmics-Sequenzspeichern gespeichert sind

Lösungen

Videos


Bewältigung der wissenschaftlichen und IT-Herausforderungen im Zusammenhang mit der Skalierung der Omics-Analyse (22:11)


Revolutionierung der Präzisionsmedizin: Sonrai nutzt AWS für die Arzneimittelforschung (3:03)


AWS re:Invent 2023 – Omics-Innovation mit AWS HealthOmics: Amgens Weg zu schnelleren Ergebnissen


AWS re:Invent 2023 – Aufbau einer Plattform für Präzisionsmedizin mit AWS HealthOmics


AWS-HealthOmics-Workshop von A bis Z – Präsentation (43:27)


AWS On Air mit AWS HealthOmics und Open Data (20:07)


Durchgängige Nutzung von AWS HealthOmics für Genomik (2:03:06)


AWS On Air mit Ready2Run-Workflows auf AWS HealthOmics (26:34)