AWS HealthOmics Ressourcen
Dokumentation
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Benutzerhandbuch
Weitere Informationen zur Verwendung von AWS HealthOmics finden Sie im Schritt-für-Schritt-Entwicklerhandbuch.
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API-Referenz
Lesen Sie dieses Referenzhandbuch für AWS-HealthOmics-APIs und -Parameter.
Tutorials
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Umfassender HealthOmics-Workshop
Einstieg in HealthOmics-Workflows und Speicher
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HealthOmics-Tutorials
Open-Source-Repository in GitHub mit Beispielcode, der anzeigt, wie genomische und biologische Datensätze mit AWS HealthOmics gespeichert, verarbeitet und abgefragt werden
Tools
Workflow-Tools
Workflows in der Arzneimittelforschung
Diese Sammlung von AWS-HealthOmics-Workflows zur Beschleunigung der Arzneimittelforschung verwenden
Beispiel-Workflows
Private Workflows basierend auf Open-Source-Workflow-Beispielen für HealthOmics erstellen
Ausführungs-Analyzer
Ausführungs-Analyzer ist ein Tool zur Optimierung der Ausführungsleistung, das Protokolle von Ausführungsmanifesten aus CloudWatch abruft und Statistiken für eine Ausführung generiert, einschließlich der CPU- und Speicherauslastung für jede Aufgabe im Workflow
WDL Linter
Nutzung des HealthOmics-WDL-Linters zur Erkennung häufiger Workflow-Fehler vor der Ausführung von Workflows
Nextflow Linter
Lint für häufige Nextflow-Fehler, bevor ein Workflow-Skript ausgeführt wird
ECR-Helfer
Vorhandene Container mit dem ECR-Helfertool in Ihr privates ECR-Repository migrieren
Tool erneut ausführen
Archivierte Läufe aus CloudWatch-Ausführungs-Manifestprotokollen erneut ausführen
Tools zur Datenspeicherung
Lesesatz-Transfer-Manager
Einfaches Herunterladen von Dateien aus einem AWS HealthOmics-Referenz- oder Lesesatz
Ereignisgesteuerter Importeur
CDK-App, die eine ereignisgesteuerte Architektur demonstriert, die den Import von Daten in AWS HealthOmics-Sequenzspeicher automatisiert, wenn Objekte in Amazon S3 erstellt werden.
Sequenzspeicher-Manifestgenerator
Generiert ein JSON-Manifest für AWS-HealthOmics-Sequenzspeicher-Importaufträge
Suchfunktion für doppelte Lesesätze im Sequenzspeicher
Identifiziert doppelte Lesesätze, die in AWS-HealthOmics-Sequenzspeichern gespeichert sind
Lösungen
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Leitfaden für ein Labor-Data-Mesh in AWS
Dieser Leitfaden zeigt, wie Sie mit HealthOmics ein wissenschaftliches Datenmanagementsystem erstellen, das sowohl Laborinstrumentendaten als auch Softwaresysteme wie elektronische Laborbücher (ELNs) und Laborinformations-Managementsysteme (LIMS) integriert.
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Leitfaden für Digital Connected Lab in AWS
Dieser Leitfaden hilft Ihnen dabei, biowissenschaftliche Dateninstrumente und Laborsystemdateien mit AWS Cloud zu verbinden, entweder über das Internet oder eine direkte Verbindung mit geringer Latenz.
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Leitfaden zur Migration und Speicherung von Sequenzdaten mit AWS HealthOmics
Dieser Leitfaden zeigt, wie Omics-Sequenzdaten aus Amazon Simple Storage Service (Amazon S3) in AWS HealthOmics Storage importiert werden.
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Leitfaden für die multimodale Datenanalyse mit AWS-Servicestatus und ML-Services
Dieser Leitfaden zeigt, wie ein durchgängiges Framework für die Analyse multimodaler Gesundheits- und Biowissenschaftsdaten (HCLS) eingerichtet werden kann.
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Leitfaden für Bioinformatik-Workflows in AWS
Diese Anleitung zeigt, wie Sie Bioinformatik-Workflows für die Produktion in großem Maßstab erstellen und ausführen und AWS-Services für Automatisierung, Workflow-Analyse, Speicherung sowie Betriebs- und Kostenbeobachtbarkeit nutzen können.
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Leitfaden für die multimodale Datenanalyse mit AWS-Servicestatus und ML-Services
Dieser Leitfaden zeigt, wie ein durchgängiges Framework für die Analyse multimodaler Gesundheits- und Biowissenschaftsdaten (HCLS) eingerichtet werden kann.
Neuerungen
AWS HealthOmics unterstützt jetzt die DSL- und Nextflow-Versionserkennung
13.08.24
AWS HealthOmics unterstützt jetzt die dynamische Ausführungsspeicherung für private Workflows
30.04.24
AWS HealthOmics unterstützt jetzt kontoübergreifende Freigabe für private Workflows
30.04.24
AWS HealthOmics kündigt Unterstützung für das Lesen von Sequenzspeichern über Amazon-S3-APIs an
15.04.24
AWS HealthOmics bietet jetzt zusätzliche Informationen für Workflow-Ausführungen.
23.02.24
AWS HealthOmics unterstützt jetzt den Workflow „Ultima Genomics DeepVariant Ready2Run“.
05.02.24
Der AWS-HealthOmics-Sequenzspeicher enthält jetzt automatisch berechnete ETags für Lesesätze.
10.06.2023
AWS HealthOmics ist jetzt in der Region Israel (Tel Aviv) verfügbar.
26.09.2023
AWS HealthOmics bietet jetzt die Archivierung und Aufbewahrung von Workflow-Ausführungen.
30.08.2023
AWS HealthOmics unterstützt jetzt die Versionsverwaltung von Annotationsspeichern.
15.08.2023
AWS HealthOmics unterstützt die kontoübergreifende gemeinsame Nutzung von Omics-Analytics-Stores
15.08.2023
Blog-Beiträge
Beschleunigte Arzneimittelforschung mit AWS HealthOmics und NVIDIA-Vorlagen
10.07.2024
Entwicklung einer sicheren Bioinformatik-Workbench mit geringem Code-Aufwand in AWS HealthOmics
10.02.2024
Revolutionierung der generativen Biologie mit AWS und EvolutionaryScale
25.06.2024
So beschleunigt Takeda Pharmaceuticals die Bioinformatik in großem Maßstab mit AWS HealthOmics
19.06.2024
Leistungsstarke genomische Erkenntnisse mit AWS HealthOmics Analytics und Amazon EMR freischalten
30.05.2024
Orchestrierung mehrerer AWS-HealthOmics-Workflows im großen Maßstab
07.05.24
Omics-Datenanalyse mit Basepair in AWS HealthOmics demokratisieren
29.04.2024
Omics-Daten in jeder Größenordnung kostengünstig mit AWS HealthOmics speichern
24.01.2024
fMRI-Datenvorverarbeitung in AWS mithilfe von AFNI und AWS HealthOmics
08.01.2024
Neue Tools zur Beschleunigung von Workflow-Migrationen zu AWS HealthOmics
13.12.2023
Multimodale Datenanalyse mit AWS-Servicestatus und Machine-Learning-Services
16.10.2023
Ihre genomischen Workflows und Daten mit AWS HealthOmics schützen
09.10.2023
Videos
Bewältigung der wissenschaftlichen und IT-Herausforderungen im Zusammenhang mit der Skalierung der Omics-Analyse (22:11)
Revolutionierung der Präzisionsmedizin: Sonrai nutzt AWS für die Arzneimittelforschung (3:03)
AWS re:Invent 2023 – Omics-Innovation mit AWS HealthOmics: Amgens Weg zu schnelleren Ergebnissen
AWS re:Invent 2023 – Aufbau einer Plattform für Präzisionsmedizin mit AWS HealthOmics
AWS-HealthOmics-Workshop von A bis Z – Präsentation (43:27)
AWS On Air mit AWS HealthOmics und Open Data (20:07)
Durchgängige Nutzung von AWS HealthOmics für Genomik (2:03:06)
AWS On Air mit Ready2Run-Workflows auf AWS HealthOmics (26:34)