Bereitstellung von Illumina DRAGEN in der AWS Cloud mit neuem Quick Start

Veröffentlicht am: Oct 2, 2018

Dieser Quick Start stellt die Dynamic Read Analysis für GENomics Complete Suite (DRAGEN CS), eine Datenanalyseplattform von Illumina, in etwa 15 Minuten in der AWS Cloud bereit.

DRAGEN CS ermöglicht die ultraschnelle Analyse von Next-Generation-Sequencing-Daten (NGS), reduziert die zur Analyse von Genomdaten erforderliche Zeit beträchtlich und verbessert die Genauigkeit. Es umfasst Bioinformatik-Pipelines, die hochoptimierte Algorithmen zur Kartierung, Ausrichtung, Sortierung, Duplikatmarkierung und Haplotypvariant-Calling bereitstellen. Zu diesen Pipelines gehören DRAGEN Germline V2, DRAGEN Somatic V2 (Tumor und Tumor/Normal), DRAGEN Virtual Long Read Detection (VLRD), DRAGEN RNA Gene Fusion, DRAGEN Joint Genotyping und GATK Best Practices.

Das Quick Start erstellt eine AWS-Umgebung über zwei Verfügbarkeitszonen für Hochverfügbarkeit und stellt zwei AWS Batch-Rechenumgebungen für Spot Instances und On-Demand-Instances bereit. Diese Umgebungen enthalten DRAGEN F1-Instances, die zur Hardwarebeschleunigung mit feldprogrammierbaren Gate-Arrays (FPGAs) verbunden sind.

Dies sind Ihre ersten Schritte:

Laden Sie auch die AWS CloudFormation-Vorlagen zur Automatisierung der Bereitstellung von GitHub herunter.
 
Weitere AWS Quick Start-Referenzbereitstellungen finden Sie in unserem Katalog.
 
Quick Starts sind automatisierte Referenzbereitstellungen, die anhand von AWS CloudFormation-Vorlagen und unter Einhaltung der bewährten Methoden von AWS Schlüsseltechnologien auf AWS implementieren. Dieser Quick Start wurde von Illumina in Zusammenarbeit mit AWS-Lösungsarchitekten erstellt. Illumina ist ein Advanced Technology Partner von AWS.